Em dezembro de 2022, a CBF modificou os critérios de classificação para a copa nacional, distribuindo as vagas para as federações e extinguindo a classificação via ranking de clubes. Com as novas regras, a Federação Paulista de Futebol (FPF) ganhou seis vagas.
Cinco delas foram direcionadas para os primeiros colocados do Paulistão – Palmeiras, Água Santa, Bragantino, Ituano e São Bernardo. O Peixe foi eliminado ainda na fase de grupos da competição e terminou na 12ª posição geral.
A sexta vaga da FPF ficará com o campeão da Copa Paulista, torneio organizado pela entidade no segundo semestre. O Santos chegou a disputar a competição nos anos de 2016, 2017, 2018 e 2021, mas não se inscreveu para a edição de 2023.
Sem possibilidade de classificação via torneios da Federação Paulista, o Peixe ainda poderia conquistar uma das vagas reservadas pela CBF para clubes entram diretamente na terceira fase da Copa do Brasil. Os campeões da própria copa nacional e da Sul-Americana, além os classificados para a Libertadores em 2023, estarão garantidos na edição do torneio nacional do ano que vem.
Caso isso não aconteça, o Santos voltará a ficar de fora de uma edição de Copa do Brasil após 11 anos. Na ocasião, em 2012, times classificados para a Libertadores não disputavam o mata-mata nacional, e o Peixe estava no torneio sul-americano na condição de atual campeão.
Desde que a Libertadores teve um aumento no número de participantes e a quantidade de vagas via Brasileirão foi ampliada, em 2016, o Santos ficou fora da zona de classificação para a competição em apenas três ocasiões.
CLASSIFICAÇÕES DO SANTOS PARA A LIBERTADORES VIA BRASILEIRÃO DESDE 20162016 – Vagas até o 6º colocado / Santos vice-campeão2017 – Vagas até o 8º colocado / Santos terminou na 3ª posição2018 – Vagas até o 6º colocado / Santos terminou na 10ª posição2019 – Vagas até o 8º colocado / Santos vice-campeão2020 – Vagas até o 8º colocado / Santos terminou na 8ª posição2021 – Vagas até o 8º colocado / Santos terminou na 10ª posição2022 – Vagas até o 8º colocado / Santos terminou na 12ª posição
